第三季的故事发生在意大利战争与萨丁尼亚战争的历史背景之后。
　　皇帝弗朗茨(Philip Froissant 饰)从战场归来，身心都受到严重创伤。他无法摆脱战争中数千名年轻士兵死亡的负罪感，皇室的政治压力也让他的统治面临新的挑战。
　　伊丽莎白皇后(Devrim Lingnau Islamo?lu 饰)努力挽救婚姻，同时希望推动她认为对帝国有益的改变。然而，她的努力并未得到丈夫的充分回应。弗朗茨的不忠进一步破坏两人的关系，宫廷内部的阻力与伊丽莎白自身的健康问题也迫使她离开维也纳，前往一座遥远的岛屿休养。
　　旅途中，伊丽莎白意外遇见匈牙利革命运动的领导者安德拉希伯爵(Dejan Bu?in 饰)。两人迅速产生强烈的思想吸引与情感张力，使她不得不重新审视自己的婚姻、欲望与责任。
　　与此同时，弗朗茨的弟弟马克西米利安(Johannes Nussbaum 饰)与妻子玛丽(Josephine Thiesen 饰)踏上前往墨西哥的冒险旅程，准备在那里登上帝国王位。
　　随着私人情感与帝国政治相互交织，伊丽莎白最终必须面对一个决定：不顾一切追随自己的内心，还是履行作为皇后对人民的责任？